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Foi a 17 de setembro de 1999 que se fundou a Escola de Futebol de Tomar. Rui Costa, sócio nº 1 da EFTA, foi o mentor do projeto, seguido pelo um grupo de amigos.
Inicialmente a EFTA foi pensada para formar jovens, em várias vertentes desportivas ex: massagistas, árbitros, treinadores. Com o passar do tempo a associação tomou um rumo diferente do inicialmente previsto. As crianças tomaram lugar na escola de futebol de Tomar a formar equipas de futebol com atletas dos 5 aos 16 anos.
Atualmente antigos jogadores da Escola de Futebol são estudantes em cursos superiores de desporto, árbitros, massagistas e fisioterapeutas, o que muito orgulha a EFTA.